Genoma
LarLar > Notícias > Genoma

Genoma

Mar 12, 2024

Genética da Natureza (2023)Cite este artigo

6 Altmétrico

Detalhes das métricas

O transtorno da compulsão alimentar periódica (TCAP) é o transtorno alimentar mais comum, mas sua arquitetura genética permanece amplamente desconhecida. Estudar o TCAP é desafiador porque muitas vezes é comórbido com obesidade, uma característica comum e altamente poligênica, e é subdiagnosticado em conjuntos de dados de biobancos. Para resolver essa limitação, aplicamos uma abordagem supervisionada de aprendizado de máquina (usando 822 casos de indivíduos diagnosticados com TCAP) para estimar a probabilidade de cada indivíduo ter TCAP com base em registros médicos eletrônicos do Programa Milhão de Veteranos. Realizamos um estudo de associação genômica ampla de indivíduos de ascendência africana (n = 77.574) e europeia (n = 285.138), controlando o índice de massa corporal para identificar três loci independentes próximos aos genes HFE, MCHR2 e LRP11 e sugerir APOE como um risco gene para TCAP. Identificamos a herdabilidade compartilhada entre o TCAP e vários traços neuropsiquiátricos, e implicamos o metabolismo do ferro na fisiopatologia do TCAP. No geral, nossas descobertas fornecem insights sobre a genética subjacente ao TCAP e sugerem direções para futuras pesquisas translacionais.

Esta é uma prévia do conteúdo da assinatura, acesse através da sua instituição

Acesse a Nature e 54 outras revistas do Nature Portfolio

Obtenha Nature+, nossa assinatura de acesso on-line de melhor valor

$ 29,99 / 30 dias

cancelar a qualquer momento

Assine esta revista

Receba 12 edições impressas e acesso online

$ 189,00 por ano

apenas $ 15,75 por edição

Alugue ou compre este artigo

Os preços variam de acordo com o tipo de artigo

a partir de US$ 1,95

para US$ 39,95

Os preços podem estar sujeitos a impostos locais que são calculados durante a finalização da compra

As estatísticas resumidas do BED GWAS dos dados do MVP estão disponíveis no dbGaP (nº de acesso phs001672). Para os conjuntos de validação externa para a análise de herdabilidade particionada, usamos regiões abertas de cromatina de um modelo de estimulação de beta-estradiol de células eritróides murinas (nº de acesso GEO GSE114996), atlas de cromatina aberto de cérebros humanos adultos (nº de acesso GEO GSE147672) e aberto atlas de cromatina de órgãos humanos em desenvolvimento (https://descartes.brotmanbaty.org/bbi/human-chromatin-during-development). Para estatísticas resumidas do GWAS para análises de correlação genética, consulte o Projeto IEU Open GWAS (https://gwas.mrcieu.ac.uk).

O software utilizado neste estudo incluiu os seguintes programas: EIGENSOFT v.6 (https://github.com/dreichlab/eig); FUMA v.1.3.7 (https://fuma.ctglab.nl); GCTA v.1.93.2 (https://yanglab.westlake.edu.cn/software/gcta/#Overview); KING v.2.0 (https://www.chen.kingrelatedness.com); Regressão de pontuação LD v.1.0.1 (https://github.com/bulik/ldsc); liftOver v.1.2.0 (https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgLiftOver); Minimac v.3 (https://genome.sph.umich.edu/wiki/Minimac3); Meta-análise multi-ancestral (https://github.com/JonJala/mama); PheMED (https://github.com/DiseaseNeuroGenomics/PheMED); PRS-CS (https://github.com/getian107/PRScs); SuSiE conforme implementado em echolocatoR72 (https://github.com/RajLabMSSM/echolocatoR).

Mitchell, KS et al. Transtorno da compulsão alimentar periódica: uma investigação em nível de sintoma das influências genéticas e ambientais na responsabilidade. Psicol. Med. 40, 1899–1906 (2010).

Artigo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Reichborn-Kjennerud, T., Bulik, CM, Tambs, K. & Harris, JR Influências genéticas e ambientais na compulsão alimentar na ausência de comportamentos compensatórios: um estudo de gêmeos de base populacional. Internacional J. Coma. Desordem. 36, 307–314 (2004).

Artigo PubMed Google Scholar

Udo, T. & Grilo, CM Prevalência e correlatos de transtornos alimentares definidos pelo DSM-5 em uma amostra representativa nacionalmente de adultos dos EUA. Biol. Psiquiatria 84, 345–354 (2018).

Artigo PubMed PubMed Central Google Scholar